MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. RO-NN-1 chromosome

Total Repeats: 12869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017195	T	7	7	13	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017195	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017195	T	6	6	76	81	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017195	TAT	2	6	145	150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017195	GATT	2	8	220	227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017195	CA	3	6	229	234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017195	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017195	TAT	2	6	294	299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017195	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017195	AGG	2	6	391	396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017195	CTA	2	6	1870	1875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017195	CTA	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017195	T	6	6	1888	1893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017195	AT	5	10	1898	1907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017195	AGG	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017195	CTG	2	6	3082	3087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017195	TTTCCC	2	12	3133	3144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017195	T	9	9	3152	3160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017195	T	6	6	4813	4818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017195	AT	3	6	4826	4831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017195	T	6	6	6816	6821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017195	GCA	2	6	6838	6843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017195	TA	3	6	6858	6863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017195	T	6	6	6984	6989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017195	T	6	6	9484	9489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017195	TGT	2	6	9536	9541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017195	A	6	6	9589	9594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017195	AGT	2	6	9629	9634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017195	GA	3	6	9641	9646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017195	CA	3	6	9649	9654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017195	T	6	6	9700	9705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017195	AGTC	2	8	9729	9736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017195	ACT	2	6	9739	9744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017195	GGC	2	6	9782	9787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017195	GCG	2	6	9842	9847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017195	CCTG	2	8	9872	9879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017195	GTT	2	6	9923	9928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017195	CGA	2	6	10027	10032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017195	GCA	2	6	10101	10106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017195	CGC	2	6	10148	10153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017195	GTGA	2	8	10154	10161	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017195	TGT	2	6	10187	10192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017195	GAA	2	6	10197	10202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017195	CAG	2	6	10270	10275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017195	ATT	2	6	10311	10316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017195	AGA	2	6	10411	10416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017195	GGA	2	6	10461	10466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017195	CT	3	6	10486	10491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017195	GAG	2	6	10509	10514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017195	TGC	2	6	10606	10611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017195	GAA	2	6	10725	10730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017195	GGT	2	6	10799	10804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017195	GTC	2	6	10813	10818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017195	TCGTG	2	10	10822	10831	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017195	GGA	2	6	10925	10930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017195	ATC	2	6	10949	10954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017195	AC	3	6	10976	10981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017195	AC	3	6	11145	11150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017195	CAC	2	6	11160	11165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017195	AGCC	2	8	11208	11215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017195	GAT	2	6	11231	11236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017195	CCT	2	6	11287	11292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017195	GGT	2	6	11446	11451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017195	CCA	2	6	11468	11473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017195	TA	3	6	11477	11482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017195	AGG	2	6	11525	11530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017195	CCA	2	6	11555	11560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017195	GGACG	2	10	11695	11704	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017195	AAGC	2	8	11731	11738	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017195	CAC	2	6	11770	11775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017195	GGA	2	6	11855	11860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017195	GCG	2	6	11889	11894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017195	AGG	2	6	12007	12012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017195	TC	3	6	12039	12044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017195	CGG	2	6	12063	12068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017195	GGA	2	6	12095	12100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017195	AGT	2	6	12216	12221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017195	AGA	2	6	12297	12302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017195	CACG	2	8	12426	12433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017195	TC	3	6	12499	12504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017195	AGC	2	6	12757	12762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017195	TTC	2	6	12855	12860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017195	TGG	2	6	12912	12917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017195	ACA	2	6	13062	13067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017195	ACC	2	6	13083	13088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017195	G	6	6	13108	13113	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017195	AGG	2	6	13118	13123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017195	GCGA	2	8	13213	13220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017195	TAG	2	6	13225	13230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017195	GAG	2	6	13312	13317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017195	GA	3	6	13335	13340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017195	GA	3	6	13414	13419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017195	CGG	2	6	13572	13577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017195	GA	3	6	13670	13675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017195	TAGG	2	8	13788	13795	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017195	TAC	2	6	13842	13847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017195	CGC	2	6	13872	13877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017195	CGGG	2	8	13884	13891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017195	CCT	2	6	13930	13935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017195	GGT	2	6	14066	14071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017195	CGT	2	6	14261	14266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017195	GAG	2	6	14310	14315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017195	GTT	2	6	14364	14369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017195	C	6	6	14437	14442	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_017195	GAT	2	6	14488	14493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017195	ATCG	2	8	14549	14556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017195	ATG	2	6	14578	14583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017195	GA	3	6	14605	14610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017195	TTTG	2	8	14621	14628	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017195	G	6	6	14704	14709	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017195	CGC	2	6	14730	14735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017195	CAAG	2	8	14736	14743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017195	T	6	6	14769	14774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017195	ATA	2	6	15815	15820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017195	T	8	8	17364	17371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017195	TGT	2	6	17397	17402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017195	GAA	2	6	17438	17443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017195	GATG	2	8	18816	18823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017195	A	6	6	18850	18855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017195	TAA	2	6	18865	18870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017195	A	6	6	18869	18874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017195	TA	3	6	18909	18914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017195	ATT	2	6	18924	18929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017195	GCT	2	6	19892	19897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017195	TAG	2	6	20564	20569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017195	CT	3	6	20575	20580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017195	AG	3	6	20586	20591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017195	TGGT	2	8	20596	20603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017195	ATCC	2	8	20630	20637	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017195	A	7	7	20794	20800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017195	A	7	7	22159	22165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017195	GGA	2	6	22225	22230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017195	TCC	2	6	22308	22313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017195	AT	3	6	22348	22353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017195	T	6	6	22391	22396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017195	TCC	2	6	23708	23713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017195	A	7	7	23782	23788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017195	ACA	2	6	23820	23825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017195	AGC	2	6	23844	23849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017195	GGAAA	2	10	23859	23868	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017195	GAA	2	6	23993	23998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017195	TGGA	2	8	24024	24031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017195	CTG	2	6	24097	24102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017195	GGC	2	6	24225	24230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017195	CCG	2	6	24231	24236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_017195	AAC	2	6	24263	24268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017195	CTG	2	6	24323	24328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017195	GGA	2	6	24403	24408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017195	CT	3	6	24422	24427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017195	AATG	2	8	24457	24464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017195	TCT	2	6	24479	24484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017195	TCG	2	6	24528	24533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017195	ATC	3	9	24591	24599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017195	TGT	2	6	24602	24607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017195	CAT	2	6	24934	24939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_017195	TGAA	2	8	25092	25099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017195	CCT	2	6	25105	25110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_017195	GAAA	2	8	25132	25139	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017195	A	6	6	25756	25761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_017195	TAAG	2	8	26449	26456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017195	GGAA	2	8	26511	26518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017195	GCA	2	6	26519	26524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_017195	ATCA	2	8	26621	26628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_017195	T	6	6	26662	26667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017195	ATG	2	6	26719	26724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017195	GGA	2	6	26731	26736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017195	AG	3	6	28448	28453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017195	TCT	2	6	29657	29662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_017195	T	6	6	30037	30042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017195	GAAAA	2	10	30043	30052	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_017195	GTT	2	6	30392	30397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_017195	TGT	2	6	30656	30661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_017195	TAA	2	6	45189	45194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017195	TAT	2	6	45198	45203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017195	CTA	2	6	45205	45210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_017195	TA	3	6	45263	45268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_017195	T	7	7	45293	45299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017195	ATT	2	6	45326	45331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017195	GTAT	2	8	45344	45351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017195	AT	3	6	45350	45355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_017195	AT	3	6	45414	45419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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